Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF13CQ96RJ3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms