Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms