Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTV1Q96GA3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTV1Q96GA3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms