Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDAQ92838 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDAQ92838 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDAQ92838 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDAQ92838 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDAQ92838 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms