Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms