Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C9orf163Q8N9P6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms