Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EID3Q8N140 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EID3Q8N140 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms