Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP9

ZNF547, Zinc finger protein 547, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF547Q8IVP9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF547Q8IVP9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms