Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms