Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms