Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF17Q5VTA0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms