Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms