Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms