Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms