Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms