Protein–RNA interactions for Protein: Q494W8

CHRFAM7A, CHRNA7-FAM7A fusion protein, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRFAM7AQ494W8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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