Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms