Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms