Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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COL24A1Q17RW2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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COL24A1Q17RW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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COL24A1Q17RW2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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COL24A1Q17RW2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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