Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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