Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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