Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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