Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms