Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms