Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms