Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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