Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms