Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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