Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms