Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NR1D2Q14995 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NR1D2Q14995 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NR1D2Q14995 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NR1D2Q14995 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR1D2Q14995 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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