Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms