Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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