Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IHHQ14623 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IHHQ14623 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IHHQ14623 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms