Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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