Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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PDE7AQ13946 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PDE7AQ13946 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDE7AQ13946 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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