Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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