Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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