Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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