Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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