Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms