Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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