Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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