Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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