Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms