Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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