Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GTF3C1Q12789 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF3C1Q12789 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF3C1Q12789 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1Q12789 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GTF3C1Q12789 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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