Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms