Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms