Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms