Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms